منطقه حفاظت‌شده باغ شادی، با مساحتی حدود 34٬000 هکتار، در جنوبی‌ترین نقطه استان یزد و در مرز بین استان‌های یزد و فارس واقع شده است. این منطقه در ارتفاعات سلسله جبال زاگرس قرار دارد و از ویژگی‌های جغرافیایی خاصی برخوردار است. ارتفاعات آن از 2٬000 متر تا 2٬500 متر بالاتر از سطح دریا متغیر است و توپوگرافی آن عمدتاً کوهستانی و تپه‌ماهوری است. این تنوع ارتفاعی باعث می‌شود که منطقه دارای شرایط آب‌وهوایی و اکوسیستم‌های متنوعی باشد که از اهمیت ویژه‌ای برای حفظ تنوع زیستی برخوردار است.

پوشش گیاهی منطقه حفاظت‌شده باغ شادی شامل جنگل‌های طبیعی و مراتع است که مهم‌ترین گونه‌های درختی این منطقه شامل بنه (پسته وحشی)، بادام کوهی، کیکم، ارژن، انجیر و آلوچه وحشی هستند. درختان بنه به‌ویژه در این منطقه به‌وفور یافت می‌شوند و از آنجا که به خشکی مقاوم هستند، نقش مهمی در حفظ پوشش گیاهی و جلوگیری از فرسایش خاک ایفا می‌کنند. علاوه بر این، در این منطقه، گیاهان دارویی مختلفی نیز رشد می‌کنند که نشان‌دهنده غنای زیستی منطقه است. دشت‌های وسیع و پوشش گیاهی متنوع این منطقه، آن را به یکی از زیستگاه‌های مهم در زاگرس تبدیل کرده است.

منطقه حفاظت‌شده باغ شادی به‌عنوان یک پناهگاه طبیعی، زیستگاه بسیاری از گونه‌های جانوری نادر و ارزشمند است. از جمله پستانداران این منطقه می‌توان به خرس قهوه‌ای، کاراکال، کفتار، گرگ، روباه معمولی، شغال، گراز و خوک وحشی اشاره کرد. علاوه بر این، گوزن زرد ایرانی که از گونه‌های در معرض خطر است، در این منطقه در حال تکثیر است. به‌عنوان یکی از مقاصد محبوب طبیعت‌گردی و اکوتوریسم، منطقه باغ شادی با چشم‌اندازهای بکر، جنگل‌های انبوه، حیات‌وحش غنی و ویژگی‌های خاص خود، محیطی منحصر به‌فرد را برای گردشگران فراهم می‌کند. این منطقه نه‌تنها به‌عنوان یک زیستگاه مهم برای گونه‌های گیاهی و جانوری، بلکه به‌عنوان یک جاذبه گردشگری طبیعی، به حفاظت و توجه ویژه‌ای نیاز دارد.